做了广西DNA亲子鉴定才懂基因结构变异

广西DNA亲子鉴定有许多CNV位于基因结构变异的复杂区域，一些CNV与邻近SNP存在着连锁不平衡，可通过检验SNP基因型推测邻近的CNV，但另一些CNV独立分布于基因组内，不能直接通过检测SNP而得到。而且，位于同一区域的SNP、STR基因型和CNV会相互影响。这些基因组的多点变异会影响基因的正确分型与评分，故通过标记SNP对CNV进行分型较为困难。

    近期，广西DNA亲子鉴定又有三项关于CNV的全基因组研究公布。其中，Conrad等(2006)和McCarroll等(2006)的研究是基于“国际单倍体计划”(The International HapMap Project)公布的SNP数据。由于“国际单倍体计划”的SNP数据信息丰富，具有较高的空间分辨率，较适合用于研究影响SNP基因型分布的CNV。

    McCarroll等猜想拷贝数缺失变异会以3种形式的“足迹( footprints)”表现在SNP数据上，包括：

    ①特定个体携带的无效基因型；

    ②邻近区域SNP等位基因频率背离Hardy-Weinberg平衡原理预期估计值；

    ③SNP基因型运算结果不符合盂德尔遗传模式。McCarroll等发现了541个拷贝数缺失变异，大小介于1～745kb。其中．120个为纯合子缺失（即两条染色体上拷贝数均缺失）。在这些纯合子缺失中，10个CNV表现为有表达活性的多个外显子缺失，是个体在脂质代谢、嗅觉和药物反应性等方面产生差异的原因。

    Conrad等(2006)共发现了586个拷贝数缺失变异，大小介于3×10z～1.2×10e bp，同时指出大多数缺失的CNV区域是相对的乏基因区域，揭示了基因的拷贝数缺失服从净化选择，尽管如此，人类基因或多或少还是受到拷贝数缺失的影响。研究发现．92个基因存在完全性缺失，109个基因的编码序列存在部分性缺失。Hinds等利用高通量寡核苷酸芯片杂交24个无血缘个体的DNA样本，共发现215个潜在的缺失片段，大小介于70～1×104bp之间。随后对其中100个CNV进行PCR验证时发现，41个缺失变异相关等位基因频率≥IO%。再次对100个CNV在71个无血缘个体中进行重复性检验，同时用相同人群构成的1. 6M的SNP图谱进行基因分型研究，结果发现，CNV普遍与周围相关的SNP具有连锁不平衡的遗传关联，证明CNV与SNP具‘有相似的进化过程。